Алтай — край тысяч озер. Они расположены по всей его территории. Большая часть алтайских озер находится в Кулундинской низменности и на Приобском плато.
Озера Кулундинской низменности являются остатками древнего моря, существовавшего на месте равнин. Самое большое озеро в крае — Кулундинское. Берега его плоские, низменные, сливающиеся с равнинной поверхностью Кулунды. Кулундинское озеро мелководное, питается водами реки Кулунды и подземными водами. К югу от Кулундинского находится Кучукское озеро. По режиму и питанию оно сходно с Кулундинским. Эти озера соединялись протокой, теперь она перегорожена дамбой.
Озера приобского плато имеют вытянутую форму они располагаются в ложбинах древнего стока, на месте старых русел, которые переуглубились в результате деятельности текучих вод, возникших при таянии древнего ледника. Многие озера соединены между собой протоками и реками в длинные цепи. Пресные озера дают начало Касмале, Барнаулке и другим левым притокам Оби.
Озера Бие-Чумышской возвышенности небольшие по размерам, пресные. На поймах равнинных рек, в древних и современных долинах встречаются озера-старицы.
Озера Горного Алтая отличаются от равнинных происхождением, глубиной, питанием, режимом и составом воды. По происхождению они делятся на тектонические, ледниковые, запрудные и пойменные. Телецкое озеро — это тектонический грабен, обработанный ледниками. Берегами Телецкого озера являются склоны гор, окружающих его и поднимающихся на 2000 м над поверхностью. Почти всюду отвесные скалы погружаются в воду на десятки метров.
Ледниковые озера невелики по размерам, они заполняют кары холодной водой. В высокогорной части Алтая озера образуются при подпруживании долин моренами и дают начало рекам. Часть озер расположена в углублениях моренных отложений — на Чулышманском плоскогорье, по террасам рек, на выровненных поверхностях древнего пенеплена, на плоских участках водоразделов.
