Озера находятся на вершине Семинского хребта — г. Сарлык (2507 м). Система озер расположена на северо-западном склоне Семинского хребта, почти на вершине г. Сарлык (2507 м). Нижнее Туюкское озеро лежит на высоте 2110 м над уровнем моря, максимальная глубина 3 м. Озеро ледникового происхождения. Верхнее Туюкское озеро располагается на дне древнего кара, расположенного в северном направлении. Оно лежит на расстоянии 2 км от Нижнего озера и превышает его на 310 м.
Абсолютная высота 2420 м, максимальная глубина 6,6 м.
