На северо-восток от хребта Биш-Иирду, у его подножья, в заболоченной местности, которую многие называют Ештык-Коль, вблизи одного из левых притоков р. Чуи находится несколько мелких озер. Здесь находится и озеро Джангысколь, расположенное на абсолютной высоте 1750 м. Оно имеет овальную форму с наибольшей шириной до 1400 м.
Озеро имеет ледниково-подпрудное происхождение. Образовано ледником, который выходил из долины р. Корумду и запруживал сток рек от ледников западной части северного склона Северо-Чуйского хребта. В результате образовалось озеро, которое занимало котловину урочища Ештык-Коль. Остатками этого озера и являются озера Джангысколь и Караколь (Черное озеро), на западе котловины. Последнее расположено в 6 км северо-западнее оз. Джангысколь на высоте 1802 м и имеет длину 1300 м, ширину до 600 м.
Свидетельством больших размеров этого водоема является распространение толщи озерных осадков в восточной части котловины. Здесь широкое развитие получили различные формы термокарста.
