Река Пыжа берёт начало из системы небольших горных озёр, расположенных в южной оконечности хребта Алтынту неподалеку от вершины в 2714 м. С запада ее долина ограничена Сумультинским хребтом, с востока — хребтом Алтынту. Длина реки составляет 103 км. О характере реки можно судить из ее названия. Пыжа на русский язык переводится как каменная. Долина реки слабо заселена, многие посёлки заброшены. Впадает Пыжа в реку Бия в 17 км от северо-западной оконечности Телецкого озера (истока р. Бия).